基因组转座元件改变帕金森病的进展
一项涉及利物浦大学研究人员的研究描述了转座元件如何与帕金森氏症亚型和影响疾病轨迹相关联。
该研究发表在《实验生物学和医学》上,分析了转座元件(可以改变其在基因组中位置的DNA序列)的变异,以及它们对帕金森病不同轨迹的影响。
研究人员使用了帕金森病进展标志物计划的患者数据,该计划是由迈克尔·J·福克斯基金会资助的帕金森病患者最大的国际纵向队列之一,来自也有全基因组测序数据的患者。这使得研究人员能够为这些患者的转座元件开发全面的基因组筛选,并检测它们对疾病进展的影响。
该研究发现了与帕金森氏症亚型和疾病轨迹相关的转座元件。患者基因组中的一些转座元件预测疾病进展更快,运动或认知功能迅速恶化。有趣的是,转座元素的效果不是单向的。
根据它们在基因组中的类型和位置,这些元素可能会产生负面或正面的影响。一些因素与功能性帕金森病评分的强烈且具有临床意义的变化有关,包括统一帕金森病评定量表的40分变化。同时,一些转座元件具有保护作用,并且与较慢的疾病进展有关,表明神经元丢失和神经变性减慢。
转座元件占人类基因组的70%以上,但直到最近,它们还被认为是没有任何有意义功能的“垃圾”DNA。这些元素在大多数遗传研究中在很大程度上被忽视,并可能导致影响疾病发展的未知遗传因素。
这些研究人员先前的研究表明,这些元素在基因组中具有显着的调节作用。它们调节许多基因的表达,协调复杂的基因激活,其中需要多个基因进行复杂的反应,越来越多的证据表明这些元素具有主要的致病作用,其中几种元素被证明会导致疾病。
该研究由西澳大利亚珀斯默多克大学佩伦神经学和转化科学研究所遗传流行病学研究负责人Sulev Koks教授领导,默多克大学佩伦研究所和约翰奎因教授小组。
“转座元件是被称为'黑暗基因组'的基因组的一部分,”资深作者Sulev Koks教授说。“我们的研究表明,黑暗基因组对复杂疾病的病理生理学的影响可能比以前估计的要大得多。
“黑暗基因组内的元素可以增强或减缓帕金森病的进展,从而为精准医学开辟新的机会。
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