研究揭示植物RNA编辑的神秘本质

RNA(核糖核酸)编辑是在RNA水平上维持编码蛋白质基本功能的重要过程。最近的研究表明，RNA编辑是一种普遍存在的现象，发生在各种陆地植物中，包括苔藓，苔藓，角苔，石榴荚，蕨类植物和开花植物。然而，除蕨类植物外，组内和组间叶绿体RNA编辑的比较研究很少。

为了更好地了解植物叶绿体中的RNA编辑，中国科学院武汉植物园的研究人员选择了代表三个遥远进化分支(蕨类植物，裸子植物和被子植物)的不同植物物种，并根据RNA-seq数据量确定了数千个编辑位点。该研究已发表在《植物系统学与进化》杂志上，题为“三个主要植物分支的叶绿体转录本中RNA编辑的多样性”。

结果显示，经过严格筛选，共有5，203个编辑位点位于21个物种的叶绿体基因中。RNA编辑位点数量的聚类关系与基于基因序列的系统发育树大致匹配，证实了RNA编辑在整个植物王国中相对保守，大致遵循进化规律。

编辑位点的数量随着植物的进化而减少，编辑事件在早期分化植物中比在后期分化植物中更频繁地发生，这表明RNA编辑可能同时发生在不同分支的早期分化植物中，并在进化过程中遭受了巨大的损失。

此外，还探讨了编辑水平在密码子位置、物种和编辑基因三个方面的分布。结果发现，21个物种和基因的平均RNA编辑水平差异很大，最低为0.42，atpA基因(ATP合酶α亚基基因)最高，为0.88。本研究检测到的胞嘧啶含量随进化而降低，进一步表明基因组序列的情况是后期分支植物编辑损失的重要驱动因素。

这些结果揭示了三个主要植物分支的叶绿体转录本中RNA编辑的多样性，研究中许多已确定的位点以前没有报道过，这将有助于理解植物中RNA编辑的神秘性质。